Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms