Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms