Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CTNNAL1Q9UBT7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms