Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLKQ9UBE8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLKQ9UBE8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLKQ9UBE8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLKQ9UBE8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLKQ9UBE8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLKQ9UBE8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLKQ9UBE8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NLKQ9UBE8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLKQ9UBE8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLKQ9UBE8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLKQ9UBE8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLKQ9UBE8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NLKQ9UBE8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NLKQ9UBE8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLKQ9UBE8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLKQ9UBE8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NLKQ9UBE8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLKQ9UBE8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLKQ9UBE8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLKQ9UBE8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLKQ9UBE8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLKQ9UBE8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLKQ9UBE8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLKQ9UBE8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLKQ9UBE8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLKQ9UBE8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms