Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUCLA2Q9P2R7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUCLA2Q9P2R7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUCLA2Q9P2R7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUCLA2Q9P2R7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUCLA2Q9P2R7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUCLA2Q9P2R7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUCLA2Q9P2R7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUCLA2Q9P2R7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUCLA2Q9P2R7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUCLA2Q9P2R7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SUCLA2Q9P2R7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SUCLA2Q9P2R7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SUCLA2Q9P2R7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SUCLA2Q9P2R7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SUCLA2Q9P2R7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SUCLA2Q9P2R7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SUCLA2Q9P2R7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SUCLA2Q9P2R7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms