Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP35Q9P2H5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
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