Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRD1Q9P1U0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNRD1Q9P1U0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNRD1Q9P1U0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNRD1Q9P1U0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNRD1Q9P1U0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNRD1Q9P1U0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNRD1Q9P1U0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNRD1Q9P1U0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNRD1Q9P1U0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNRD1Q9P1U0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNRD1Q9P1U0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNRD1Q9P1U0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNRD1Q9P1U0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNRD1Q9P1U0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNRD1Q9P1U0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNRD1Q9P1U0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNRD1Q9P1U0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNRD1Q9P1U0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNRD1Q9P1U0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNRD1Q9P1U0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNRD1Q9P1U0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNRD1Q9P1U0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNRD1Q9P1U0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNRD1Q9P1U0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNRD1Q9P1U0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNRD1Q9P1U0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNRD1Q9P1U0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNRD1Q9P1U0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNRD1Q9P1U0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNRD1Q9P1U0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNRD1Q9P1U0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNRD1Q9P1U0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNRD1Q9P1U0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNRD1Q9P1U0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms