Protein–RNA interactions for Protein: Q9P109

GCNT4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT4Q9P109 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GCNT4Q9P109 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT4Q9P109 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT4Q9P109 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT4Q9P109 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT4Q9P109 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT4Q9P109 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT4Q9P109 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT4Q9P109 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT4Q9P109 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT4Q9P109 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT4Q9P109 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT4Q9P109 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT4Q9P109 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT4Q9P109 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT4Q9P109 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT4Q9P109 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT4Q9P109 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT4Q9P109 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT4Q9P109 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT4Q9P109 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT4Q9P109 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT4Q9P109 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms