Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMOD3Q9NYL9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms