Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYK1

TLR7, Toll-like receptor 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR7Q9NYK1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TLR7Q9NYK1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLR7Q9NYK1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms