Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHBDL2Q9NX52 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHBDL2Q9NX52 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHBDL2Q9NX52 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHBDL2Q9NX52 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHBDL2Q9NX52 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHBDL2Q9NX52 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHBDL2Q9NX52 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHBDL2Q9NX52 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHBDL2Q9NX52 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHBDL2Q9NX52 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHBDL2Q9NX52 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHBDL2Q9NX52 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHBDL2Q9NX52 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHBDL2Q9NX52 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHBDL2Q9NX52 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHBDL2Q9NX52 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHBDL2Q9NX52 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHBDL2Q9NX52 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHBDL2Q9NX52 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHBDL2Q9NX52 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHBDL2Q9NX52 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHBDL2Q9NX52 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHBDL2Q9NX52 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RHBDL2Q9NX52 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHBDL2Q9NX52 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHBDL2Q9NX52 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHBDL2Q9NX52 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHBDL2Q9NX52 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHBDL2Q9NX52 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHBDL2Q9NX52 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHBDL2Q9NX52 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHBDL2Q9NX52 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHBDL2Q9NX52 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RHBDL2Q9NX52 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RHBDL2Q9NX52 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RHBDL2Q9NX52 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RHBDL2Q9NX52 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms