Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLN6Q9NWW5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLN6Q9NWW5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLN6Q9NWW5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLN6Q9NWW5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLN6Q9NWW5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLN6Q9NWW5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLN6Q9NWW5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLN6Q9NWW5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLN6Q9NWW5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLN6Q9NWW5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLN6Q9NWW5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLN6Q9NWW5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLN6Q9NWW5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLN6Q9NWW5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLN6Q9NWW5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLN6Q9NWW5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms