Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PARVAQ9NVD7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PARVAQ9NVD7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PARVAQ9NVD7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PARVAQ9NVD7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PARVAQ9NVD7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PARVAQ9NVD7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PARVAQ9NVD7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PARVAQ9NVD7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PARVAQ9NVD7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PARVAQ9NVD7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PARVAQ9NVD7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PARVAQ9NVD7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PARVAQ9NVD7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PARVAQ9NVD7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PARVAQ9NVD7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PARVAQ9NVD7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PARVAQ9NVD7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PARVAQ9NVD7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PARVAQ9NVD7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PARVAQ9NVD7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PARVAQ9NVD7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PARVAQ9NVD7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PARVAQ9NVD7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PARVAQ9NVD7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PARVAQ9NVD7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PARVAQ9NVD7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PARVAQ9NVD7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PARVAQ9NVD7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PARVAQ9NVD7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PARVAQ9NVD7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms