Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms