Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUP7

TRMT13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT13Q9NUP7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms