Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPRMQ9NS64 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms