Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRH2

SNRK, SNF-related serine/threonine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRKQ9NRH2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRKQ9NRH2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRKQ9NRH2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms