Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BATF3Q9NR55 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BATF3Q9NR55 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BATF3Q9NR55 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BATF3Q9NR55 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BATF3Q9NR55 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BATF3Q9NR55 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BATF3Q9NR55 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BATF3Q9NR55 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BATF3Q9NR55 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BATF3Q9NR55 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BATF3Q9NR55 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BATF3Q9NR55 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BATF3Q9NR55 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BATF3Q9NR55 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BATF3Q9NR55 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BATF3Q9NR55 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BATF3Q9NR55 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BATF3Q9NR55 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BATF3Q9NR55 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BATF3Q9NR55 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BATF3Q9NR55 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BATF3Q9NR55 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BATF3Q9NR55 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BATF3Q9NR55 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BATF3Q9NR55 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BATF3Q9NR55 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BATF3Q9NR55 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
BATF3Q9NR55 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BATF3Q9NR55 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms