Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM10Q9NQV6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM10Q9NQV6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM10Q9NQV6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM10Q9NQV6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM10Q9NQV6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM10Q9NQV6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM10Q9NQV6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM10Q9NQV6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM10Q9NQV6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM10Q9NQV6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM10Q9NQV6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM10Q9NQV6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM10Q9NQV6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms