Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPRD1BQ9NQG5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms