Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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