Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTN4Q9NQC3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN4Q9NQC3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms