Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CASS4Q9NQ75 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASS4Q9NQ75 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms