Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLXNA4Q9HCM2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms