Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAD4

WDR41, WD repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR41Q9HAD4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
WDR41Q9HAD4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
WDR41Q9HAD4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
WDR41Q9HAD4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
WDR41Q9HAD4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
WDR41Q9HAD4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
WDR41Q9HAD4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
WDR41Q9HAD4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
WDR41Q9HAD4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
WDR41Q9HAD4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
WDR41Q9HAD4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
WDR41Q9HAD4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
WDR41Q9HAD4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms