Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF1DQ9H5J8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF1DQ9H5J8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms