Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1M0

NUP62CL, Nucleoporin-62 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62CLQ9H1M0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP62CLQ9H1M0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms