Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC8Q9H0W5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms