Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTDSP1Q9GZU7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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