Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.3 ms