Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms