Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM3Q9BZL3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms