Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDCA4Q9BXL8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms