Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC94Q9BW85 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms