Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IFT27Q9BW83 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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