Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms