Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT09

CNPY3, Protein canopy homolog 3, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY3Q9BT09 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNPY3Q9BT09 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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