Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM29Q9BSF4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM29Q9BSF4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM29Q9BSF4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM29Q9BSF4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM29Q9BSF4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM29Q9BSF4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM29Q9BSF4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM29Q9BSF4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM29Q9BSF4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM29Q9BSF4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM29Q9BSF4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM29Q9BSF4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM29Q9BSF4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM29Q9BSF4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TIMM29Q9BSF4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM29Q9BSF4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM29Q9BSF4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM29Q9BSF4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM29Q9BSF4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM29Q9BSF4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM29Q9BSF4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM29Q9BSF4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM29Q9BSF4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM29Q9BSF4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM29Q9BSF4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM29Q9BSF4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM29Q9BSF4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM29Q9BSF4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM29Q9BSF4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TIMM29Q9BSF4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TIMM29Q9BSF4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TIMM29Q9BSF4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMM29Q9BSF4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms