Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C2orf88Q9BSF0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms