Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRQ6

CHCHD6, MICOS complex subunit MIC25, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD6Q9BRQ6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD6Q9BRQ6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD6Q9BRQ6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms