Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms