Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SGIP1Q9BQI5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SGIP1Q9BQI5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms