Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TREX2Q9BQ50 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TREX2Q9BQ50 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TREX2Q9BQ50 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TREX2Q9BQ50 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TREX2Q9BQ50 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TREX2Q9BQ50 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TREX2Q9BQ50 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TREX2Q9BQ50 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TREX2Q9BQ50 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TREX2Q9BQ50 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TREX2Q9BQ50 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TREX2Q9BQ50 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TREX2Q9BQ50 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TREX2Q9BQ50 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TREX2Q9BQ50 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TREX2Q9BQ50 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TREX2Q9BQ50 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TREX2Q9BQ50 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TREX2Q9BQ50 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TREX2Q9BQ50 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TREX2Q9BQ50 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TREX2Q9BQ50 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TREX2Q9BQ50 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TREX2Q9BQ50 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TREX2Q9BQ50 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TREX2Q9BQ50 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
TREX2Q9BQ50 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TREX2Q9BQ50 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TREX2Q9BQ50 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms