Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ04

RBM4B, RNA-binding protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4BQ9BQ04 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBM4BQ9BQ04 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms