Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELF4Q99607 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELF4Q99607 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELF4Q99607 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELF4Q99607 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELF4Q99607 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELF4Q99607 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELF4Q99607 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELF4Q99607 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELF4Q99607 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELF4Q99607 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELF4Q99607 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELF4Q99607 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELF4Q99607 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELF4Q99607 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELF4Q99607 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELF4Q99607 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms