Protein–RNA interactions for Protein: Q99459

CDC5L, Cell division cycle 5-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC5LQ99459 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC5LQ99459 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC5LQ99459 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms