Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CRBNQ96SW2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms