Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
LMTK3Q96Q04 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC30■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC30■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LMTK3Q96Q04 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms