Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms