Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM20AQ96MK3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms